A equipe do projeto Amigos da Jubarte é formado por ambientalistas de diversas áreas, desde a ciência, comunicação, administração e cultura. Uma equipe multidisciplinar é um grande pilar para o desenvolvimento de um projeto complexo, que pretende alcançar objetivos tanto na área da pesquisa cientifica, quanto nas não menos importantes, sensibilização ambiental e fomento do turismo sustentável. Todos esses esforços se aglutinam no objetivo maior, a conservação das baleias-jubarte e todo o ecossistema habitado por elas.